Die Schaltung einer elektronischen Mückenklatsche besteht hauptsächlich aus einem Hochfrequenz-Oszillatorkreis, einem Aufwärtstransformator und einem Spannungsvervielfacher-Gleichrichterkreis. Nach Drücken des Netzschalters wandelt der Schwingkreis die von der Batterie bereitgestellte niedrige Gleichspannung in hochfrequenten Wechselstrom um. Diese wird zunächst durch den Transformator auf mehrere hundert Volt angehoben und dann durch die aus Dioden und Kondensatoren bestehende Spannungsvervielfacher-Gleichrichterschaltung weiter auf eine Hochspannungs-Gleichspannung von 1500–4200 V angehoben und dann an das Metallgitternetz angelegt.
Die meisten Produkte verwenden eine dreischichtige Metallgitterstruktur. Die beiden äußeren Schichten des Metallgeflechts haben die gleiche Polarität und die mittlere Schicht hat die entgegengesetzte Polarität. Wenn Insekten wie Mücken und Fliegen gleichzeitig mit der äußeren und mittleren Schicht des Netzes in Kontakt kommen, fungieren ihre Körper als Leiter, bilden einen Kurzschluss, lösen eine Hochspannungsentladung aus und werden durch den Strom und den Lichtbogen getötet.
Die Sicherheit elektrischer Mückenklatschen basiert auf der Konstruktion „Hochspannung, geringer Strom“. Ihre Betriebsspannung kann mehrere tausend Volt erreichen, der Ausgangsstrom ist jedoch äußerst gering, typischerweise zwischen einigen Milliampere und mehreren zehn Milliampere. Der Industriestandard QB/T 4496-2013 schreibt vor, dass die Arbeitsspannung des Hochspannungsnetzes einer elektrischen Mückenklatsche im Bereich von 2000 V bis 4200 V liegen sollte.
Unter normalen Bedingungen ist das äußere Netz nicht aufgeladen und das Produkt kann Restelektrizität eliminieren und die Spannung zwischen den Netzen innerhalb von Sekunden nach der Stromunterbrechung auf einen sicheren Bereich reduzieren. Alle Proben konnten die Spannung innerhalb von 5 Sekunden nach der Stromunterbrechung auf unter die für den Menschen sichere Spannung von 36 V senken.
Einige High-End-Modelle oder neuere Modelle verfügen über eine Funktion zum Anlocken von Mücken-. Dies funktioniert, indem es die Phototaxis von Mücken nutzt und ultraviolettes Licht einer bestimmten Wellenlänge aussendet, um Mücken an das elektrische Netz zu locken.